ประวัติความเป็นมา
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน เริ่มเปิดการเรียนการสอน เมื่อวันที่ 12 พฤศจิกายน 2522 ซึ่งแต่เดิมหน่วยงานส่วนกลางของมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน ได้แยกมาจากกองต่าง ๆ ของสำนักงานอธิการบดี วิทยาเขตบางเขน
จนกระทั่ง 6 มกราคม 2532 โดยประกาศในพระราชกิจจานุเบกษา เล่มที่ 107 ตอนที่ 26 ลงวันที่ 15 กุมภาพันธ์ 2533 ได้จัดตั้งหน่วยงานระดับกองขึ้นที่มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน 2 กอง คือ กองธุรการ (กำแพงแสน) และกองบริการการศึกษา (กำแพงแสน) โดยยังให้เป็นหน่วยงานในสังกัดสำนักงานอธิการบดี วิทยาเขตบางเขน
ในการประชุมสภามหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 1/2545 เมื่อวันที่ 28 มกราคม 2545 มีมติให้จัดตั้งสำนักงานวิทยาเขตกำแแพงแสน เพื่อทำหน้าที่ประสานงานกลางในการบริหาร และการจัดการด้านการเรียนการสอน มีการแบ่งส่วนราชการออกเป็น 2 กอง ประกอบด้วยกองธุรการ (กำแพงแสน) และกองบริการการศึกษา (กำแพงแสน)
ต่อมาสภามหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ได้มีมติ ให้มีการปรับปรุงโครงสร้างหน่วยงานในสังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน
วันที่ 23 เมษายน 2547 มีการปรับโครงสร้างหน่วยงาน โดยยกฐานะหน่วยกีฬา และงานกิจการนิสิต และสวัสดิการ ในสังกัดกองบริการการศึกษา (กำแพงแสน) เป็น "ศูนย์กีฬา กำแพงแสน" มีสถานภาพเทียบเท่ากอง สังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน
วันที่ 6 มิถุนายน 2548 มีการปรับโครงสร้าง โดยยกฐานะงานกิจการนิสิตและสวัสดิการ ในสังกัดกองบริการการศึกษา (กำแพงแสน) เป็น "กองกิจการนิสิต (กำแพงแสน)" ซึ่งเป็นหน่วยงานระดับกอง สังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน และปรับเพิ่มหน่วยงานระดับกองชื่อ "กองอาคารสถานที่และยานพาหนะ (กำแพงแสน)" สังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน
วันที่ 21 ตุลาคม 2552 มีการปรับโครงสร้างหน่วยงาน โดยยกฐานะ "งานเทคโนโลยีสารสนเทศ" ในสังกัดกองบริการการศึกษา (กำแพงแสน) เป็น "ศูนย์เทคโนโลยีสารสนเทศ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน" มีสถานภาพเทียบเท่ากอง สังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน
วันที่ 30 ธันวาคม 2552 จัดตั้ง "ศูนย์หนังสือ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน" เป็นหน่วยงานในสังกัดงานทรัพย์สิน และสิทธิประโยชน์ กองธุรการ (กำแพงแสน) สำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน ที่ไม่มีการกำหนดสถานภาพ และไม่แบ่งส่วนราชการ
วันที่ 25 กรกฎาคม 2554 รับโอน "โครงการจัดตั้งวิทยาเขตสุพรรณบุรี" มาสังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน (ตามมติสภามหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ในการประชุมครั้งที่ 7/2554 เมื่อวันที่ 25 กรกฎาคม 2554)
วันที่ 10 สิงหาคม 2554 จัดตั้ง "ศูนย์วิจัยและพัฒนามาตรฐานสินค้าเกษตร" เป็นศูนย์เชี่ยวชาญเฉพาะทาง ให้เป็นหน่วยงานในสังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน เป็นหน่วยงานที่ไม่มีการกำหนดสภานภาพ และไม่แบ่งส่วนราชการเช่นเดียวกับศูนย์หนังสือ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ วิทยาเขตกำแพงแสน จัดตั้งขึ้นเพื่อเป็นศูนย์ประสานงานความร่วมมือทางวิชาการ และวิจัยด้านมาตรฐานสินค้าเกษตร ระหว่างมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ กับสำนักงานมาตรฐานสินค้าเกษตร และอาหารแห่งชาติ (มกอช.)
วันที่ 26 พฤศจิกายน 2556 รับโอนหน่วยงานสังกัดสถาบันวิจัยและพัฒนา กำแพงแสน จำนวน 3 หน่วยงาน คือ "ฝ่ายบริหาร และธุรการ ฝ่ายประสานงานวิจัย และเผยแพร่ และฝ่ายเครื่องจักรกลการเกษตรแห่งชาติ" มาเป็นหน่วยงานในสังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน
วันที่ 1 กุมภาพันธ์ 2557 รับโอนโครงการในสังกัดสถาบันสุวรรณวาจกกสิกิจ เพื่อการค้นคว้า และพัฒนาปศุสัตว์ และผลิตภัณฑ์สัตว์ จำนวน 2 โครงการ คือ "โครงการศึกษาวิจัย และใช้ประโยชน์การเลี้ยงวรานัสเพื่อผลทางเศรษฐกิจ และโครงการผลิตและพัฒนาผลิตภัณฑ์สมุนไพร" มาเป็นหน่วยงานในสังกัดสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน
วันที่ 3 พฤศจิกายน 2557 ปรับโครงสร้างการแบ่งส่วนราชการภายในสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน ตามมติสภามหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ครั้งที่ 7/2557 เมื่อวันที่ 28 กรกฎาคม 2557 และตามประกาศมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ เรื่องการปรับโครงสร้างการแบ่งส่วนราชการภายในสำนักงานวิทยาเขตกำแพงแสน ลงวันที่ 10 ตุลาคม 2557 เหลือเพียง 4 กอง คือ กองบริหารทั่วไป กองบริหารวิชาการและนิสิต กองบริหารการวิจัยและบริการวิชาการ และกองบริการกลาง